Pessoal,
No dia 14 de julho de 2015, a Microsoft encerra o suporte do Windows Server 2003, que possui o IIS 6. É interessante que planeje a migração para o Windows Server 2008 ou 2012. Se você roda aplicações 32 bits, é possível emular e funciona. Entendo que é complicado migrar aplicações antigas, mas um dia isso teria que ser feito. Sem o suporte, o Windows ficará vulnerável, e sua aplicação também.